مدیر حوزه های علمیه کشور با تمجید از شخصیت علمی و اخلاقی آیت الله ملکوتی فرمودند: ایشان شخصیت کم نظیری بودند که حوزه نجف و قم را درک کردند و آن عالم بزرگ حقیقتا جامع مکتب نجف و قم بود.
حضرت آیت الله سید هاشم حسینی بوشهری مدیر حوزه های علمیه در دیدار خانواده مرحوم آیت الله العظمی ملکوتی که در دفتر مدیر حوزه برگزار شد، ضمن تجلیل از مقام علمی و معنوی مرحوم آیت الله ملکوتی(ره) بیان داشتند:ایشان شخصیت کم نظیری بودند که به خوبی حوزه نجف اشرف و قم را درک کردند و آن عالم بزرگ حقیقتا جامع مکتب نجف و قم بودند.
استاد سطوح عالی حوزه های علمیه یادآور شدند:همواره تبریز در پرورش عالمان بزرگ سابقه طولانی داشته است و زمانی در تبریز د‌ه‌ها مجتهد مسلَم حضور داشتند و به تربیت شاگردان دینی و ترویج معارف اهل بیت(ع)همت می گماشتند و امروز نیز طلاب و فضلای تبریز، همچنان اهتمام ویژه ای به درس و بحث دارند و تلاش آنها در کسب معارف اهل بیت(ع)و آشنا کردن مردم با آموزه های اسلامی ستودنی است.
آیت الله حسینی بوشهری با اشاره به روایتی از امام صادق(ع)تاکید کردند: حقیقتا هیچ کس جای عالم و فقیه از دست رفته را نمی گیرد، چرا که هرعالم و دانشمند دینی ویژگی هایی دارد که منحصر به فرد است و کس دیگری نمی تواندجای اورا بگیرد و مرحوم آیت الله ملکوتی نیز این چنین بودند و آن عالم بزرگ هیچگاه به دنبال مطرح کردن خود نبودند.
عضو خبرگان رهبری در پایان اظهار امیدواری کردند:امیدواریم که با قدر شناسی مردم تبریز،قم و سایر مردم مومن و متدین ایران اسلامی آلام روحی خانواده آن عام بزرگ تسکین پیدا کند و با عزم و جزم بیشتری مسیر آن عالم برجسته ادامه پیدا کند و روح آن مرحوم را شاد نمایند.