حضرت آيت الله سید هاشم حسيني بوشهري «دامت برکاته»، مدير حوزه‌هاي علميه کشور وظايف بخش امور پژوهشي را به شوراي طرح و برنامه حوزه جهت اطلاع و اجرا ابلاغ نمودند.
متن ابلاغ وظايف بخش «امور پژوهشي» از سوي مدير حوزه‌هاي علميه کشور در 15 بند بدين شرح مي‌باشد: تدوين و پيشنهاد سياستها، آيين نامهها و مقررات پژوهشي مراکز تخصص و مؤسسات آموزش عالي و ارائه به معاونت پژوهش؛ برنامهريزي فعاليتهاي پژوهشي مراکز و مؤسسات و ايجاد هماهنگي ميان آنها؛ هماهنگي با معاونت پژوهش حوزه‌هاي علميه در اجراي سياستها و برنامههاي کلان پژوهشي؛ ساماندهي مدارک علمي، رسالهها و پايان نامههاي تحصيلي مراکز و مؤسسات آموزش عالي حوزوي در چارچوب استانداردها و اولويتهاي پژوهشي و ساير ضوابط؛ تشکيل کميتههاي تخصصي مرتبط با موضوعات پايان نامههاي تحصيلي مراکز و مؤسسات آموزش عالي حوزوي؛ انجام امور مربوط به خدمات پژوهشي از قبيل حمايت از نشستها و همايشهاي علمي، نشريات، قطبها و کانونهاي علمي و کرسيهاي نظريه پردازي؛ ساماندهي امور کتابخانهها و اسناد علمي مراکز تخصصي و مؤسسات آموزش عالي.
بر اساس اين گزارش؛ نظارت بر حسن اجراي کليه امور پژوهشي و فن آوري، کتابخانهها و بانکهاي اطلاعاتي مراکز تخصصي و مؤسسات آموزش عالي، مطابق مصوبات، مقررات و آيين نامههاي مربوطه؛ برنامهريزي و سياست گذاري به منظور ارتقاي سطح همکاريهاي علمي در سطح ملي و بين المللي؛ توسعه، تقويت و هدايت طرحهاي پژوهشي طلاب با اولويت پژوهشهاي مورد نياز؛ کنترل و نظارت بر فرآيندهاي پژوهشي مراکز تخصصي و مؤسسات آموزش عالي حوزوي؛ ارزش يابي فعاليتهاي پژوهشي مراکز تخصصي و مؤسسات آموزش عالي حوزوي؛ ايجاد ارتباط مناسب با مؤسسات داخلي و خارجي به منظور افزايش همکاري در امور پژوهشي و مبادله خدمات علمي؛ همکاري در اجراي دورههاي کوتاه مدت و برگزاري کارگاههاي پژوهشي براي مراکز تخصصي و مؤسسات؛ تهيه و پيشنهاد آيين نامههاي مورد نياز پژوهشي با مشارکت مراکز تخصصي و مؤسسات آموزش عالي از ديگر وظايف بخش امور پژوهشي حوزه مي‌باشد.